Desde 2012, la Basílica del Gran Poder cuenta en su coro con un órgano realizado en Logroño en 1798 por el organero Pablo de Salazar para el monasterio cisterciense de Vileña (Burgos). Se trata del instrumento más antiguo conservado de este autor, anterior al de la iglesia de San Nicolás de Jubera (La Rioja). Desde su emplazamiento original, tras un incendio, pasa a formar parte de la colección de N. H. D. Rodrigo de Zayas en Sevilla. A partir de 2005, comienza el proceso de restauración dirigido por el organero Manuel Luengo Flores y el restaurador Juan Alberto Filter. El instrumento sería finalmente colocado en una renovada tribuna diseñada por Jacinto Pérez Elliott.
El órgano cuenta con único teclado partido de octava corta con la disposición de registros que presenta la tabla.
Mano izquierda:
- Chirimía
- Bajoncillo
- Trompeta Real
- Compuesta de lleno
- Decisetena nasarda
- Decinovena
- Quincena
- Docena
- Octava
- Flautado de 13
- Flautado Violón
Mano derecha:
- Clarín claro
- Clarín de campaña
- Trompeta Real
- Trompeta Magna
- Corneta de 6h.
- Compuesta de lleno
- Nasardo (4h.)
- Flauta travesera
- Quincena-Decinovena
- Docena
- Octava
- Flautado de 13
- Flautado Violón
Temperamento: Valotti, Afinación: a’=435 Mhz (20ºC), Presión del aire: 65 mm.